林木辣椒50K cGPS液相芯片“辣芯一号”研发告捷

发布时间:2024-06-26 11:37:47    浏览:

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  辣椒(Capsicum annuumL.)属于茄科,是我国蔬菜物业中第一大物业,拥有主要的经济价钱。辣椒栽培史乘好久,种类资源丰盛(图1),近年来辣椒常例育种赢得了很大的结果,但跟着消费需求的升级,对辣椒种类口感、色彩、强壮优质等多样性的需求加深,供应品格精良的种类是目前辣椒育种的兴盛对象。行使高通量、低本钱的新颖基因型分型身手造就优质、高产辣椒新种类,关于晋升我国辣椒育种身手水准,鞭策辣椒物业兴盛拥有主要意旨。

  华智生物身手有限公司与湖南农业大学邹学校院士辣椒育种团队互帮,行使自立研发的cGPS(Genotyping byPinpointSequencing ofcaptured targets)靶向测序分型身手,开荒了辣椒50KcGPS液相育种芯片“辣芯一号”(已获专利授权)。该育种芯片可操纵于辣椒种质资源遗传多样性评估、种类确切性判决、遗传图谱构修、基因定位、全基因组相干剖析、分子辅帮定向改造和多基因齐集、智能育种等多个操纵场景,为造就高产、优质、抗逆的优异新种类供应高效基因型判决身手支柱。

  基于湖南农业大学供应的176份辣椒主要种质资源以及国内/表洋民多数据库的347份分歧区域辣椒种类及种质资源(亚洲、美洲、非洲和欧洲等基因库的辣椒栽培种、野生种、分歧根源以及果形多样的育种种类)的重测序数据,开采筛选取得51,172个高质地、高多态性全基因组SNP位点(图2),位点正在染色体上漫衍匀称(图3)。

  辣椒液相育种芯片包蕴26个辣椒农艺性状干系基因(抗病、辣椒果实色彩、辣椒辣味及辣椒雄性不育等)相干的389个SNP分子象征(表1),可用于主要性状基因的精准判决和开采行使等。

  该芯片遵照《植物种类判决—MNP象征法》(GB/T 38551-2020)中已揭橥的辣椒MNP象援引物序列,笼罩831个方向区间的3,194个SNP分子象征,可用于辣椒种类线、产物身手参数精良

  经测试验证,产物位点检出率高,均匀位点检出率为99.65%(图4);产物稳固性好,基因型正确高,批内反复样本基因型均匀相似率为99.99%(图5),与重测序样本基因型均匀相似率为99.73%(图6),产物具体本能精良。

  华智生物是正在农业村庄部首倡以及国度发改委、科技部、湖南省等干系部省委扶帮下,由中信农业、隆平高科等十余家龙头种企和专业机构合伙组修的、我国当先的第三方生物种业闭头共性身手平台和国度级分子育种改进任职平台林木,入选国度农作物、畜禽、水产三大类种业阵型专业化平台企业和首批20家种业打假维权种子检测机构引荐名单。

  华智生物调解生物身手(BT)与数据身手(DT),为客户供应基因型判决、种质资源判决评判、性状基因创建开采判决、生物新闻剖析、种质改进创建、分子和智能育种、生物智能大数据处理和操纵、种类测试评判、种子质地/泥土境况/农产物安详查验检测、生物身手法则任职等全链条、一站式归纳管理计划。华智生物的产物和身手任职贯穿种业全物业链,笼罩了农作物林木、畜禽、水产、果蔬、林木林木、花卉、中药材、微生物等250多个物种规模,每年为800余家单元和团队供应任职,年实行任职合同1,000余份,年检测样品高出130万份。

  湖南农业大学辣椒育种身手改进及新种类选育改进团队组修于1988年11月。发动人邹学校教师林木,中国工程院院士,岳麓山测验室主任林木,湖南农业大学校长,我国出名的蔬菜遗传育种家,辣椒遗传育种学术发动人,国度特点蔬菜物业身手体例首席科学家,兼任中国园艺学会副理事长。团队成员共有28人,个中教师/商讨员14人,副教师/副商讨员4人;博士商讨生22个,硕士商讨生6个;国务院津贴5人;海表优青1人,千青1人,湖南省拔尖人才1人。

  30多年来,团队正在辣椒优异种质资源创建、育种身手改进、新种类造就等方面赢得了系列改进性效率,育成了我国栽培面积最大的系列辣椒种类,设立修设了保留份数最多的辣椒种质资源库,创建了操纵最广的辣椒骨干亲本,构修了目前国际上新闻量最大的转录组和辣椒泛基因组专业数据库,正在辣椒遗传育种和种质资源改进商讨规模继续处于国际当先水准。团队获“国度科学身手前进奖”二等奖4项、湖南省“科技前进奖”一等奖5项、二等奖3项。先后主理或担任国度和省级宏大项目60多项,创开国度特点蔬菜物业身手研发中央、园艺作物种质改进与分子育种指导部国际互帮合伙测验室、园艺作物种质资源改进与新种类选育指导部工程商讨中央等研发平台10个,成立寰宇独一以单个蔬菜作物为对象的期刊《辣椒杂志》。团队成员掌管国度特点蔬菜物业身手体例首席科学家、加工用鲜辣椒种类改造岗亭专家、种子种苗坐蓐身手岗亭专家、国度大宗蔬菜物业身手体例辣椒育种岗亭专家等5人。出书《辣椒遗传育种学》《中国辣椒》等著述20多部,正在《Nature》、《Nature communications》、《Molecular Plant》、《New Phytologist》、《中国农业科学》等主要刊物上公布论文400多篇,出书刊物10多本;取得授权专利近50项;植物新种类权10个,种类备案105个;协议国度行业法式1项,湖南省地方法式32项。2012年团队被农业部授予“农业科研卓绝人才及其改进团队”,2013年获“中国园艺学会华耐园艺科技奖”,2017年获原农业部“中华科技奖”(杰出改进团队奖)林木,2018年获湖南省“科技前进奖”(改进团队),2021年获“寰宇专业身手人才前辈团体”。林木辣椒50K cGPS液相芯片“辣芯一号”研发告捷

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